Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Golden Retriever

Updated Apr 22, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Golden Retriever (n=900)
1002	380 365 281 181	0.0006
1003	387 375 277 186	0.1422
1006	387 375 293 180	0.0156
1008	386 373 289 182	0.0017
1011	376 365 281 180	0.0006
1012	388 369 289 188	0.0011
1014	375 373 287 178	0.0444
1016	382 371 277 178	0.0044
1030	380 373 293 178	0.0011
1040	380 371 277 186	0.0006
1050	380 371 289 182	0.0006
1059	390 371 291 182	0.0006
1062	382 371 277 183	0.0861
1065	380 371 277 181	0.2694
1066	376 375 277 178	0.2800
1067	376 373 277 178	0.0450
1068	380 373 287 181	0.0489
1069	380 365 281 184	0.0389
1070	380 375 291 178	0.0133
1071	380 373 277 178	0.0006
1121	380 371 277 183	0.0006
1128	384 376 287 182	0.0006
1129	382 371 277 181	0.0006
1134	384 365 291 178	0.0006
1137	383 371 281 184	0.0011
1144	390 369 289 182	0.0006
1145	392 373 281 186	0.0006

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Golden Retriever (n=900)
2001	343 324 284	0.1428
2003	343 324 282	0.0206
2005	339 322 280	0.0139
2007	351 327 280	0.0156
2012	345 322 280	0.0006
2017	343 322 280	0.0383
2021	339 324 268	0.0861
2022	339 327 282	0.0006
2023	341 323 282	0.0011
2029	337 324 268	0.0006
2037	341 327 280	0.0139
2045	339 325 284	0.0394
2046	339 329 280	0.2550
2047	339 331 280	0.0094
2048	339 331 282	0.2694
2049	339 331 284	0.0011
2050	341 327 284	0.0306
2051	343 331 282	0.0117
2052	345 321 280	0.0022
2053	343 324 280	0.0294
2059	343 324 276	0.0006
2079	343 323 278	0.0006
2085	345 325 280	0.0011
2086	339 329 284	0.0144
2088	339 329 268	0.0011

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Golden Retriever (n=901)
1	AHT121	90	0.0006
		96	0.2958
		98	0.0472
		100	0.0033
		102	0.4501
		104	0.0139
		106	0.1615
		108	0.0150
		110	0.0122
		112	0.0006
2	AHT137	131	0.1533
		133	0.1333
		135	0.0006
		137	0.1533
		141	0.0006
		143	0.1006
		145	0.0244
		147	0.1006
		149	0.1811
		151	0.1094
		153	0.0417
		155	0.0011
3	AHTH130	111	0.0006
		117	0.0394
		119	0.0011
		121	0.3567
		123	0.0017
		125	0.3022
		127	0.0022
		129	0.2944
		131	0.0017
4	AHTh171-A	219	0.6067
		221	0.0006
		223	0.0272
		225	0.1850
		227	0.1478
		229	0.0006
		233	0.0017
		235	0.0011
		237	0.0294
5	AHTh260	236	0.0006
		238	0.0039
		240	0.0189
		242	0.1244
		244	0.5450
		246	0.2156
		248	0.0711
		250	0.0028
		252	0.0022
		254	0.0156
6	AHTk211	87	0.0017
		89	0.0783
		91	0.1106
		93	0.6633
		95	0.0333
		97	0.1128
7	AHTk253	284	0.0033
		286	0.3572
		288	0.2683
		290	0.0122
		292	0.3589
8	C22.279	110	0.0006
		116	0.2270
		118	0.5100
		120	0.0699
		124	0.0411
		126	0.1515
9	FH2001	124	0.0905
		132	0.2003
		136	0.0300
		140	0.0444
		144	0.3568
		148	0.1676
		152	0.0932
		156	0.0161
		158	0.0006
		160	0.0006
10	FH2054	148	0.1656
		152	0.0144
		156	0.3539
		160	0.0494
		164	0.0233
		168	0.2406
		172	0.1328
		176	0.0194
		180	0.0006
11	FH2848	232	0.0756
		234	0.0400
		236	0.0278
		238	0.4578
		240	0.3972
		242	0.0011
		244	0.0006
12	INRA21	91	0.2211
		95	0.0900
		97	0.0089
		99	0.0778
		101	0.2911
		103	0.3094
		105	0.0017
13	INU005	110	0.1232
		122	0.0006
		124	0.2303
		126	0.5178
		128	0.1238
		132	0.0044
14	INU030	144	0.4056
		150	0.5056
		152	0.0889
15	INU055	210	0.1521
		212	0.0006
		214	0.4428
		216	0.2825
		218	0.1221
16	LEI004	85	0.0816
		93	0.0006
		95	0.3147
		97	0.0949
		105	0.0017
		107	0.5033
		109	0.0022
		111	0.0011
17	REN105L03	227	0.0017
		231	0.0794
		233	0.5539
		235	0.2222
		237	0.0078
		239	0.0489
		241	0.0856
		243	0.0006
18	REN162C04	202	0.0872
		204	0.3911
		206	0.2967
		208	0.2244
		212	0.0006
19	REN169D01	202	0.3561
		210	0.0011
		212	0.1389
		216	0.3839
		218	0.0889
		220	0.0311
20	REN169O18	160	0.0006
		162	0.3078
		164	0.4000
		166	0.0011
		168	0.0911
		170	0.1889
		172	0.0100
		174	0.0006
21	REN247M23	264	0.0011
		268	0.3761
		270	0.0017
		272	0.3989
		276	0.0011
		278	0.2211
22	REN54P11	222	0.0494
		226	0.0478
		228	0.0189
		230	0.0006
		232	0.3000
		234	0.4533
		236	0.1061
		238	0.0239
23	REN64E19	139	0.0294
		143	0.0067
		145	0.2808
		147	0.3552
		149	0.1876
		153	0.1398
		155	0.0006
24	VGL0760	12	0.0017
		13	0.0022
		14	0.0011
		18.2	0.0078
		19.2	0.1643
		20.2	0.1659
		21.2	0.3363
		22.2	0.0888
		23.2	0.2059
		24.2	0.0222
		25.2	0.0039
25	VGL0910	14	0.0117
		15	0.0172
		15.1	0.0200
		16	0.0044
		16.1	0.0028
		17.1	0.0455
		18.1	0.4428
		19	0.0044
		19.1	0.3080
		20	0.0044
		20.1	0.0361
		21	0.0006
		21.1	0.0777
		22.1	0.0239
		23.1	0.0006
26	VGL1063	8	0.0061
		9	0.0011
		12	0.0300
		13	0.6154
		14	0.0416
		15	0.0028
		17	0.0011
		18	0.2320
		19	0.0627
		20	0.0072
27	VGL1165	14	0.0011
		15	0.0006
		16	0.0921
		17	0.2186
		18	0.0089
		19	0.1360
		20	0.0011
		21	0.0355
		26	0.0022
		27	0.1099
		28	0.3230
		29	0.0139
		30	0.0527
		31	0.0044
28	VGL1828	14	0.1210
		15	0.0988
		16	0.0316
		17	0.0006
		18	0.0011
		19	0.4057
		20	0.1160
		21	0.0117
		22	0.2103
		23	0.0033
29	VGL2009	9	0.0006
		10	0.0033
		11	0.0072
		12	0.1471
		13	0.2214
		14	0.1815
		15	0.3812
		16	0.0572
		17	0.0006
30	VGL2409	13	0.0017
		14	0.1689
		15	0.0900
		16	0.3544
		17	0.3400
		18	0.0239
		19	0.0183
		20	0.0028
31	VGL2918	11	0.0006
		12	0.2891
		13	0.1110
		14	0.0072
		15	0.0006
		17.3	0.0189
		18.3	0.0083
		19.3	0.5111
		20.3	0.0505
		21.3	0.0017
		22.3	0.0011
32	VGL3008	13	0.0022
		14	0.4139
		15	0.0028
		16	0.0006
		17	0.0033
		18	0.0361
		19	0.2467
		20	0.0539
		21	0.0717
		22	0.0533
		23	0.0706
		24	0.0417
		25	0.0033
33	VGL3235	11	0.0006
		12	0.4261
		13	0.0061
		14	0.0600
		15	0.4156
		16	0.0378
		17	0.0278
		18	0.0261

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Golden Retriever

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	901	8.455	3.422	0.653	0.687	0.051
	SE		0.466	0.179	0.014	0.013	0.006

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Golden Retriever

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	901	7.286	2.948	0.603	0.614	0.017
	SE		0.661	0.341	0.057	0.059	0.005

Standard genetic assessment for individual STR loci

Golden Retriever

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	901	10	3.136	0.628	0.681	0.078
2	AHT137	901	12	7.568	0.838	0.868	0.035
3	AHTH130	901	9	3.259	0.647	0.693	0.067
4	AHTh171-A	901	9	2.349	0.534	0.574	0.069
5	AHTh260	901	10	2.742	0.544	0.635	0.143
6	AHTk211	901	6	2.118	0.526	0.528	0.004
7	AHTk253	901	5	3.043	0.647	0.671	0.037
8	C22.279	901	6	2.931	0.599	0.659	0.090
9	FH2001	901	10	4.639	0.745	0.784	0.051
10	FH2054	901	9	4.316	0.752	0.768	0.021
11	FH2848	901	7	2.664	0.561	0.625	0.102
12	INRA21	901	7	4.105	0.758	0.756	-0.002
13	INU005	901	6	2.844	0.626	0.648	0.035
14	INU030	901	3	2.337	0.556	0.572	0.029
15	INU055	901	5	3.186	0.660	0.686	0.037
16	LEI004	901	8	2.717	0.604	0.632	0.045
17	REN105L03	901	8	2.686	0.576	0.628	0.083
18	REN162C04	901	5	3.345	0.634	0.701	0.095
19	REN169D01	901	6	3.307	0.653	0.698	0.064
20	REN169O18	901	8	3.347	0.710	0.701	-0.013
21	REN247M23	901	6	2.861	0.612	0.651	0.059
22	REN54P11	901	8	3.201	0.652	0.688	0.051
23	REN64E19	901	7	3.837	0.685	0.739	0.074
24	VGL0760	901	11	4.578	0.759	0.782	0.029
25	VGL0910	901	15	3.313	0.660	0.698	0.054
26	VGL1063	901	10	2.277	0.543	0.561	0.032
27	VGL1165	901	14	5.115	0.767	0.804	0.047
28	VGL1828	901	10	4.036	0.725	0.752	0.037
29	VGL2009	901	9	3.964	0.720	0.748	0.037
30	VGL2409	901	8	3.587	0.698	0.721	0.033
31	VGL2918	901	11	2.777	0.630	0.640	0.015
32	VGL3008	901	13	3.983	0.707	0.749	0.056
33	VGL3235	901	8	2.772	0.582	0.639	0.089

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Golden Retriever

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	901	11	3.553	0.711	0.719	0.010
2	DLA I-4ACA	901	6	2.799	0.643	0.643	0.000
3	DLA I-4BCT	901	6	1.432	0.301	0.302	0.003
4	DLA1131	901	8	3.527	0.691	0.717	0.035
5	5ACA	901	6	1.856	0.451	0.461	0.022
6	5ACT	901	8	4.085	0.733	0.755	0.029
7	5BCA	901	6	3.380	0.692	0.704	0.017

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Golden Retriever

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Golden Retriever

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media