Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

Updated Apr 18, 2024

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	Poodle (n=5352)
1001	380 373 281 182	0.26654
1002	380 365 281 181	0.15919
1003	387 375 277 186	0.17498
1004	393 379 277 183	0.08417
1005	389 371 277 181	0.06708
1006	387 375 293 180	0.04877
1007	380 372 281 182	0.03410
1008	386 373 289 182	0.01289
1009	382 377 277 184	0.01448
1010	384 371 277 186	0.01140
1011	376 365 281 180	0.01971
1012	388 369 289 188	0.01495
1013	392 373 289 186	0.00878
1014	375 373 287 178	0.01102
1015	380 373 291 186	0.00131
1016	382 371 277 178	0.02130
1017	386 373 289 178	0.00252
1018	375 373 287 186	0.00897
1019	380 373 287 185	0.00308
1020	388 369 289 184	0.00299
1021	380 373 289 186	0.00178
1022	380 375 281 181	0.00009
1023	380 379 281 181	0.00009
1024	387 373 281 182	0.00009
1025	380 365 281 186	0.00019
1026	390 369 289 186	0.00346
1027	391 371 277 181	0.00047
1028	376 369 291 186	0.00112
1029	380 365 281 182	0.00168
1030	380 373 293 178	0.00224
1031	382 371 277 186	0.00131
1032	382 377 277 178	0.00009
1033	382 379 277 181	0.00346
1034	382 379 277 182	0.00056
1035	386 373 277 184	0.00009
1036	389 365 289 180	0.00159
1040	380 371 277 186	0.00056
1043	393 381 277 183	0.00149
1045	376 371 277 186	0.00065
1046	376 379 291 180	0.00037
1052	380 372 289 184	0.00037
1053	382 377 277 186	0.00019
1054	382 379 277 184	0.00019
1065	380 371 277 181	0.00019
1069	380 365 281 184	0.00009
1084	376 373 277 184	0.00028
1092	376 379 277 181	0.00019
1093	386 379 277 180	0.00047
1102	389 375 293 180	0.00009
1103	389 375 293 181	0.00019
1105	382 379 277 178	0.00374
1106	395 379 277 178	0.00009
1107	376 375 293 183	0.00019
1109	381 379 291 186	0.00159
1111	387 378 287 182	0.00009
1130	380 373 287 178	0.00009
1134	384 365 291 178	0.00019
1141	380 365 281 180	0.00019
1168	382 379 289 186	0.00019
1169	380 365 277 180	0.00103
1225	387 374 287 186	0.00009
1234	380 371 281 181	0.00019
1265	387 375 277 184	0.00009
1270	376 365 281 181	0.00009
1271	387 375 277 181	0.00019
1279	393 379 277 186	0.00009

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	Poodle (n=5352)
2001	343 324 284	0.59940
2002	343 327 280	0.08558
2003	343 324 282	0.10370
2004	351 327 268	0.02943
2005	339 322 280	0.01579
2006	339 325 280	0.03410
2007	351 327 280	0.01756
2008	339 327 276	0.01457
2009	351 324 280	0.00738
2010	345 329 280	0.01140
2011	345 322 284	0.01981
2012	345 322 280	0.00766
2013	345 327 284	0.01056
2014	339 322 284	0.01943
2015	339 327 280	0.00420
2016	339 323 284	0.00327
2017	343 322 280	0.00215
2019	345 324 284	0.00009
2020	349 324 284	0.00019
2021	339 324 268	0.00383
2022	339 327 282	0.00047
2023	341 323 282	0.00224
2024	343 323 280	0.00065
2025	351 321 280	0.00159
2026	351 324 284	0.00103
2028	345 327 288	0.00056
2032	339 323 280	0.00047
2035	341 323 280	0.00009
2037	341 327 280	0.00047
2039	345 327 276	0.00056
2040	345 327 280	0.00009
2048	339 331 282	0.00019
2050	341 327 284	0.00009
2053	343 324 280	0.00009
2064	351 327 284	0.00093
2066	339 324 280	0.00009
2101	341 324 280	0.00019
2115	343 327 284	0.00009

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	Poodle (n=5353)
1	AHT121	92	0.01242
		94	0.02223
		96	0.01224
		98	0.31805
		100	0.08677
		102	0.00626
		104	0.19596
		106	0.08238
		108	0.17289
		110	0.06735
		112	0.02316
		114	0.00019
		116	0.00009
2	AHT137	131	0.23001
		133	0.01028
		135	0.00037
		137	0.17601
		139	0.00047
		141	0.36790
		143	0.01299
		145	0.04727
		147	0.05615
		149	0.00224
		151	0.09613
		153	0.00019
3	AHTH130	111	0.01676
		117	0.00246
		119	0.38326
		121	0.13956
		123	0.07877
		125	0.00085
		127	0.13151
		129	0.21644
		131	0.01562
		133	0.01259
		135	0.00218
4	AHTh171-A	217	0.00635
		219	0.36979
		221	0.23249
		223	0.00635
		225	0.14422
		227	0.00925
		229	0.04913
		231	0.02055
		233	0.00112
		235	0.14095
		237	0.01980
5	AHTh260	238	0.57073
		240	0.02943
		242	0.00028
		244	0.05821
		246	0.19099
		248	0.06475
		250	0.03411
		252	0.03691
		254	0.00626
		256	0.00832
6	AHTk211	87	0.18392
		89	0.03932
		91	0.67261
		93	0.00402
		95	0.09994
		97	0.00019
7	AHTk253	280	0.00925
		284	0.12918
		286	0.11349
		288	0.40687
		290	0.21465
		292	0.12582
		296	0.00075
8	C22.279	116	0.08014
		118	0.40034
		120	0.00420
		124	0.35793
		126	0.06819
		128	0.02139
		130	0.06772
		134	0.00009
9	FH2001	124	0.02046
		132	0.42132
		136	0.07148
		140	0.01803
		144	0.24295
		148	0.21192
		152	0.01261
		158	0.00121
10	FH2054	148	0.01018
		152	0.03204
		156	0.54923
		160	0.01766
		164	0.00346
		168	0.29690
		172	0.07829
		176	0.01121
		180	0.00103
11	FH2848	230	0.01579
		232	0.01588
		234	0.01121
		236	0.05317
		238	0.13792
		240	0.68838
		242	0.07709
		244	0.00019
		246	0.00037
12	INRA21	91	0.35503
		93	0.00009
		95	0.40305
		97	0.04717
		99	0.05576
		101	0.11433
		103	0.00766
		105	0.01401
		109	0.00290
13	INU005	110	0.02018
		120	0.00009
		122	0.00056
		124	0.51373
		126	0.44863
		128	0.00187
		130	0.01205
		132	0.00047
		138	0.00243
14	INU030	144	0.31823
		146	0.14973
		148	0.06501
		150	0.08752
		152	0.37829
		154	0.00084
		156	0.00028
		158	0.00009
15	INU055	208	0.00168
		210	0.22100
		212	0.05997
		214	0.29563
		216	0.36680
		218	0.03867
		220	0.01494
		222	0.00131
16	LEI004	85	0.65468
		95	0.09966
		97	0.00486
		105	0.00075
		107	0.20829
		109	0.03176
17	REN105L03	227	0.01056
		231	0.27597
		233	0.19927
		235	0.00729
		237	0.01523
		239	0.01205
		241	0.47935
		243	0.00028
18	REN162C04	200	0.02065
		202	0.17050
		204	0.06652
		206	0.54671
		208	0.09081
		210	0.06530
		212	0.03952
19	REN169D01	202	0.00983
		210	0.00122
		212	0.07105
		214	0.00094
		216	0.40648
		218	0.26044
		220	0.00187
		222	0.05008
		224	0.17534
		226	0.02275
20	REN169O18	156	0.00131
		160	0.03307
		162	0.56951
		164	0.31493
		166	0.01663
		168	0.02354
		170	0.03242
		172	0.00859
21	REN247M23	266	0.03429
		268	0.52420
		270	0.23515
		272	0.19918
		274	0.00252
		278	0.00467
22	REN54P11	222	0.00205
		226	0.26490
		228	0.16804
		230	0.00346
		232	0.33533
		234	0.21175
		236	0.00420
		238	0.00943
		242	0.00084
23	REN64E19	139	0.00243
		143	0.00532
		145	0.42686
		147	0.24706
		149	0.03409
		153	0.25715
		155	0.02709
24	VGL0760	12	0.29652
		13	0.00112
		14	0.01429
		15	0.00841
		18	0.00159
		19	0.08576
		19.2	0.13845
		20	0.03681
		20.2	0.16246
		21	0.00131
		21.2	0.05260
		22.2	0.01644
		23.2	0.10930
		24.2	0.05988
		25.2	0.01457
		26.2	0.00047
25	VGL0910	12	0.00047
		13	0.04792
		14	0.01737
		15	0.01877
		15.1	0.01579
		16	0.00019
		16.1	0.00504
		17.1	0.10602
		18.1	0.27415
		19	0.00009
		19.1	0.13011
		20.1	0.03998
		21.1	0.27910
		22	0.00738
		22.1	0.02214
		23	0.03036
		23.1	0.00392
		24	0.00121
26	VGL1063	8	0.02793
		9	0.00234
		10	0.00009
		11	0.00168
		12	0.03447
		13	0.16075
		14	0.13871
		15	0.08509
		16	0.09920
		17	0.03092
		18	0.04437
		19	0.29927
		20	0.04175
		21	0.02494
		22	0.00682
		23	0.00159
		24	0.00009
27	VGL1165	13	0.00009
		14	0.00009
		15	0.00673
		16	0.04250
		17	0.00336
		18	0.01859
		19	0.00943
		20	0.00075
		21	0.07949
		22	0.00318
		23	0.00271
		24	0.01551
		25	0.11461
		25.3	0.00009
		26	0.47656
		27	0.10928
		28	0.10900
		29	0.00234
		30	0.00430
		31	0.00103
		32	0.00028
		34	0.00009
28	VGL1828	14	0.03764
		15	0.00056
		16	0.04698
		17	0.02186
		18	0.08771
		19	0.42808
		20	0.33654
		21	0.03363
		22	0.00691
		23	0.00009
29	VGL2009	9	0.44947
		10	0.00616
		11	0.03577
		12	0.04754
		13	0.24360
		14	0.18905
		15	0.02821
		16	0.00019
30	VGL2409	13	0.03934
		14	0.26369
		15	0.18800
		16	0.15193
		17	0.19632
		18	0.13680
		19	0.02345
		20	0.00047
31	VGL2918	7	0.00009
		12	0.00523
		13	0.11246
		14	0.20671
		15	0.15888
		16	0.04306
		16.3	0.00159
		17	0.00215
		17.3	0.03232
		18.3	0.02176
		19.3	0.11666
		20.3	0.11909
		21.3	0.14188
		22.3	0.03493
		23.3	0.00318
32	VGL3008	12	0.00009
		13	0.01130
		14	0.03437
		15	0.23435
		16	0.03802
		17	0.50177
		18	0.02531
		18.2	0.00019
		19	0.12881
		20	0.02326
		21	0.00243
		23	0.00009
33	VGL3235	12	0.15290
		13	0.04950
		14	0.15608
		15	0.04568
		16	0.30329
		17	0.22128
		18	0.07015
		19	0.00112

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5353	10.091	3.731	0.680	0.700	0.029
	SE		0.645	0.229	0.017	0.017	0.003

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Poodle

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	5353	8.714	2.993	0.584	0.605	0.034
	SE		1.173	0.466	0.057	0.059	0.006

Standard genetic assessment for individual STR loci

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	5353	13	5.272	0.795	0.810	0.020
2	AHT137	5353	12	4.271	0.752	0.766	0.018
3	AHTH130	5353	11	4.212	0.734	0.763	0.038
4	AHTh171-A	5353	11	4.258	0.756	0.765	0.011
5	AHTh260	5353	10	2.679	0.609	0.627	0.028
6	AHTk211	5353	6	2.009	0.473	0.502	0.059
7	AHTk253	5353	7	3.889	0.735	0.743	0.010
8	C22.279	5353	8	3.284	0.707	0.695	-0.017
9	FH2001	5353	8	3.479	0.694	0.713	0.026
10	FH2054	5353	9	2.516	0.600	0.602	0.004
11	FH2848	5353	9	1.991	0.473	0.498	0.049
12	INRA21	5353	9	3.256	0.671	0.693	0.032
13	INU005	5353	9	2.147	0.511	0.534	0.043
14	INU030	5353	8	3.588	0.693	0.721	0.039
15	INU055	5353	8	3.622	0.712	0.724	0.017
16	LEI004	5353	6	2.071	0.514	0.517	0.006
17	REN105L03	5353	8	2.889	0.622	0.654	0.049
18	REN162C04	5353	7	2.883	0.619	0.653	0.052
19	REN169D01	5353	10	3.677	0.689	0.728	0.054
20	REN169O18	5353	8	2.344	0.548	0.573	0.045
21	REN247M23	5353	6	2.696	0.601	0.629	0.045
22	REN54P11	5353	9	3.909	0.699	0.744	0.061
23	REN64E19	5353	7	3.212	0.667	0.689	0.032
24	VGL0760	5353	16	6.201	0.828	0.839	0.012
25	VGL0910	5353	18	5.333	0.805	0.812	0.009
26	VGL1063	5353	17	6.288	0.817	0.841	0.029
27	VGL1165	5353	22	3.663	0.689	0.727	0.053
28	VGL1828	5353	10	3.231	0.669	0.691	0.031
29	VGL2009	5353	8	3.317	0.663	0.699	0.051
30	VGL2409	5353	8	5.339	0.805	0.813	0.010
31	VGL2918	5353	15	7.509	0.858	0.867	0.010
32	VGL3008	5353	12	3.056	0.662	0.673	0.016
33	VGL3235	5353	8	5.047	0.776	0.802	0.032

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Poodle

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	5353	15	3.449	0.687	0.710	0.033
2	DLA I-4ACA	5353	11	4.805	0.774	0.792	0.023
3	DLA I-4BCT	5353	6	2.568	0.588	0.611	0.037
4	DLA1131	5353	9	4.647	0.758	0.785	0.034
5	5ACA	5353	6	1.558	0.352	0.358	0.016
6	5ACT	5353	8	1.833	0.442	0.455	0.027
7	5BCA	5353	6	2.094	0.486	0.522	0.069

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - Poodle

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media