Statistics and Breed-wide Allele Frequency - English Mastiff

Updated Jul 15, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	English Mastiff (n=31)	Mastiff (n=23)
1006	387 375 293 180	--	0.02
1016	382 371 277 178	0.15	0.13
1030	380 373 293 178	0.08	--
1033	382 379 277 181	0.02	--
1052	380 372 289 184	0.02	--
1056	386 373 289 190	0.21	0.35
1066	376 375 277 178	0.53	0.43
1221	380 365 293 180	--	0.07

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	English Mastiff (n=31)	Mastiff (n=23)
2014	339 322 284	0.15	0.13
2017	343 322 280	0.21	0.33
2023	341 323 282	0.08	--
2037	341 327 280	0.02	--
2046	339 329 280	0.52	0.43
2086	339 329 284	0.02	--
2117	353 327 280	--	0.02
2118	347 327 280	--	0.07
2128	343 323 288	0.02	0.02

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	English Mastiff (n=31)	Mastiff (n=23)
1	AHT121	92	0.02	--
		94	0.10	0.09
		96	0.13	0.22
		100	0.56	0.48
		102	0.18	0.13
		104	0.02	0.07
		108	--	0.02
2	AHT137	131	0.27	0.41
		137	0.16	0.33
		139	0.02	--
		141	--	0.04
		145	0.02	0.02
		147	0.11	0.02
		149	0.42	0.17
3	AHTH130	119	--	0.09
		121	0.35	0.37
		123	--	0.04
		125	0.02	0.02
		127	0.31	0.26
		129	0.18	0.15
		131	0.13	0.07
		135	0.02	--
4	AHTh171-A	219	0.27	0.28
		223	0.13	0.04
		225	0.24	0.30
		227	0.02	--
		229	0.05	0.07
		231	0.10	0.04
		233	0.11	0.15
		235	0.03	--
		237	0.05	0.11
5	AHTh260	238	0.56	0.41
		242	0.03	0.02
		244	0.10	0.22
		246	0.08	0.20
		250	0.23	0.15
6	AHTk211	87	0.19	0.28
		89	0.73	0.67
		91	0.03	--
		93	0.03	--
		95	0.02	0.04
7	AHTk253	286	0.61	0.70
		288	0.11	0.09
		290	0.05	0.07
		292	0.18	0.11
		296	0.05	0.04
8	C22.279	116	0.27	0.24
		118	0.08	0.11
		120	0.37	0.48
		122	0.02	--
		126	0.26	0.17
9	FH2001	128	0.03	0.02
		132	0.40	0.43
		140	0.02	0.04
		144	0.32	0.24
		156	0.23	0.26
10	FH2054	152	0.60	0.61
		156	0.16	0.24
		160	0.10	0.09
		164	0.13	0.04
		168	0.02	0.02
11	FH2848	236	0.05	0.09
		238	0.34	0.37
		240	0.44	0.41
		242	0.10	0.11
		244	0.08	0.02
12	INRA21	93	0.03	--
		95	0.45	0.59
		97	0.10	0.11
		101	0.34	0.28
		103	0.08	0.02
13	INU005	110	0.02	0.07
		122	0.05	0.02
		124	0.87	0.87
		126	0.06	--
		132	--	0.04
14	INU030	144	0.34	0.35
		148	0.03	0.11
		150	0.63	0.54
15	INU055	210	0.27	0.15
		212	--	0.02
		214	0.02	--
		216	0.02	--
		218	0.69	0.80
		220	--	0.02
16	LEI004	85	0.11	0.02
		95	0.10	0.24
		97	0.03	--
		105	0.13	0.13
		107	0.63	0.61
17	REN105L03	233	0.35	0.33
		235	0.18	0.09
		237	0.45	0.57
		245	0.02	0.02
18	REN162C04	202	0.60	0.85
		204	0.15	0.02
		208	0.26	0.13
19	REN169D01	202	0.15	0.11
		210	--	0.02
		212	0.40	0.33
		216	0.45	0.54
20	REN169O18	162	--	0.04
		164	0.02	0.02
		166	0.02	--
		168	0.11	0.09
		170	0.10	0.15
		172	0.76	0.70
21	REN247M23	268	0.84	0.89
		270	0.05	0.11
		272	0.10	--
		278	0.02	--
22	REN54P11	226	0.03	0.04
		228	--	0.04
		232	0.06	0.15
		234	0.15	0.09
		236	0.65	0.57
		238	0.11	0.11
23	REN64E19	145	0.11	0.09
		147	0.06	0.13
		149	0.03	0.11
		151	0.02	--
		153	0.77	0.67
24	VGL0760	12	0.10	0.07
		13	0.29	0.22
		20.2	--	0.02
		21.2	0.44	0.50
		22.2	0.10	0.15
		23.2	0.08	0.02
		24.2	--	0.02
25	VGL0910	12	0.15	0.20
		13	0.03	0.02
		14	--	0.02
		16.1	--	0.02
		17.1	0.11	0.02
		18.1	0.21	0.17
		19.1	0.26	0.28
		20.1	0.16	0.11
		21.1	0.05	--
		22.1	0.03	0.13
		24.1	--	0.02
26	VGL1063	13	0.11	0.09
		14	0.74	0.83
		15	0.08	0.07
		19	0.03	0.02
		20	0.03	--
27	VGL1165	14	--	0.02
		15	0.34	0.37
		16	0.02	0.04
		17	0.05	--
		18	0.10	0.13
		19	0.16	0.26
		21	0.02	--
		23	0.06	0.02
		26	0.03	0.04
		27	0.19	0.09
		28	0.03	0.02
28	VGL1828	15	0.18	0.07
		16	0.34	0.33
		17	--	0.02
		19	0.27	0.41
		20	0.21	0.13
		24	--	0.04
29	VGL2009	9	0.11	0.17
		10	0.02	0.02
		11	0.13	0.07
		12	0.02	--
		13	0.56	0.57
		14	0.16	0.17
30	VGL2409	13	0.05	--
		14	--	0.02
		16	0.02	--
		17	0.35	0.43
		18	0.31	0.35
		19	0.24	0.20
		20	0.02	--
		22	0.02	--
31	VGL2918	12	0.06	0.04
		13	0.37	0.24
		14	0.15	0.22
		15	0.02	0.07
		17.3	0.03	0.09
		18.3	0.03	0.07
		19.3	0.32	0.28
		20.3	0.02	--
32	VGL3008	14	0.05	--
		15	0.02	--
		16	0.03	--
		17	0.06	--
		18	0.31	0.26
		19	0.40	0.54
		20	0.08	0.07
		21	0.05	0.13
33	VGL3235	13	0.18	0.24
		14	0.21	0.22
		16	0.06	0.07
		17	0.53	0.43
		18	0.02	0.04

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

English Mastiff

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	54	5.970	2.881	0.590	0.602	0.021
	SE		0.333	0.189	0.027	0.026	0.016

Mastiff

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	23	5.030	2.786	0.597	0.586	-0.024
	SE		0.292	0.182	0.030	0.028	0.020

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

English Mastiff

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	54	4.571	2.237	0.534	0.534	0.002
	SE		0.341	0.169	0.042	0.036	0.021

Mastiff

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	23	3.714	2.343	0.671	0.548	-0.217
	SE		0.265	0.188	0.063	0.047	0.021

Standard genetic assessment for individual STR loci

English Mastiff

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	54	7	2.931	0.630	0.659	0.044
2	AHT137	54	7	3.703	0.611	0.730	0.163
3	AHTH130	54	8	3.951	0.722	0.747	0.033
4	AHTh171-A	54	9	5.287	0.759	0.811	0.064
5	AHTh260	54	5	3.055	0.630	0.673	0.064
6	AHTk211	54	5	1.817	0.463	0.450	-0.029
7	AHTk253	54	5	2.185	0.556	0.542	-0.024
8	C22.279	54	5	3.346	0.593	0.701	0.155
9	FH2001	54	5	3.170	0.667	0.684	0.026
10	FH2054	54	5	2.395	0.481	0.582	0.173
11	FH2848	54	5	3.097	0.722	0.677	-0.067
12	INRA21	54	5	2.686	0.574	0.628	0.085
13	INU005	54	5	1.312	0.204	0.238	0.144
14	INU030	54	3	2.115	0.500	0.527	0.052
15	INU055	54	6	1.671	0.463	0.402	-0.153
16	LEI004	54	5	2.313	0.630	0.568	-0.109
17	REN105L03	54	4	2.584	0.667	0.613	-0.088
18	REN162C04	54	3	1.834	0.407	0.455	0.104
19	REN169D01	54	4	2.532	0.574	0.605	0.051
20	REN169O18	54	6	1.783	0.352	0.439	0.199
21	REN247M23	54	4	1.333	0.259	0.250	-0.038
22	REN54P11	54	6	2.425	0.611	0.588	-0.040
23	REN64E19	54	5	1.791	0.426	0.442	0.036
24	VGL0760	54	7	3.265	0.630	0.694	0.092
25	VGL0910	54	11	5.891	0.907	0.830	-0.093
26	VGL1063	54	5	1.608	0.370	0.378	0.020
27	VGL1165	54	11	4.864	0.722	0.794	0.091
28	VGL1828	54	6	3.698	0.815	0.730	-0.117
29	VGL2009	54	6	2.653	0.685	0.623	-0.100
30	VGL2409	54	8	3.260	0.685	0.693	0.012
31	VGL2918	54	8	4.288	0.796	0.767	-0.038
32	VGL3008	54	8	3.208	0.685	0.688	0.004
33	VGL3235	54	5	3.006	0.685	0.667	-0.027

Mastiff

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	23	6	3.276	0.696	0.695	-0.001
2	AHT137	23	6	3.226	0.609	0.690	0.118
3	AHTH130	23	7	4.133	0.739	0.758	0.025
4	AHTh171-A	23	7	4.640	0.783	0.784	0.002
5	AHTh260	23	5	3.574	0.652	0.720	0.094
6	AHTk211	23	3	1.866	0.478	0.464	-0.031
7	AHTk253	23	5	1.963	0.522	0.491	-0.064
8	C22.279	23	4	3.049	0.652	0.672	0.030
9	FH2001	23	5	3.158	0.696	0.683	-0.018
10	FH2054	23	5	2.285	0.478	0.562	0.150
11	FH2848	23	5	3.058	0.826	0.673	-0.228
12	INRA21	23	4	2.290	0.435	0.563	0.228
13	INU005	23	4	1.311	0.217	0.237	0.084
14	INU030	23	3	2.336	0.609	0.572	-0.064
15	INU055	23	4	1.490	0.391	0.329	-0.190
16	LEI004	23	4	2.246	0.696	0.555	-0.254
17	REN105L03	23	4	2.305	0.609	0.566	-0.075
18	REN162C04	23	3	1.358	0.304	0.264	-0.154
19	REN169D01	23	4	2.416	0.565	0.586	0.035
20	REN169O18	23	5	1.934	0.478	0.483	0.010
21	REN247M23	23	2	1.240	0.217	0.194	-0.122
22	REN54P11	23	6	2.734	0.652	0.634	-0.028
23	REN64E19	23	4	2.039	0.609	0.509	-0.195
24	VGL0760	23	7	3.067	0.739	0.674	-0.097
25	VGL0910	23	10	5.568	0.870	0.820	-0.060
26	VGL1063	23	4	1.439	0.261	0.305	0.146
27	VGL1165	23	9	4.266	0.696	0.766	0.091
28	VGL1828	23	6	3.327	0.783	0.699	-0.119
29	VGL2009	23	5	2.600	0.609	0.615	0.011
30	VGL2409	23	4	2.867	0.739	0.651	-0.135
31	VGL2918	23	7	4.944	0.739	0.798	0.073
32	VGL3008	23	4	2.600	0.609	0.615	0.011
33	VGL3235	23	5	3.338	0.739	0.700	-0.055

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

English Mastiff

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	54	5	2.925	0.685	0.658	-0.041
2	DLA I-4ACA	54	6	2.708	0.667	0.631	-0.057
3	DLA I-4BCT	54	3	2.031	0.463	0.508	0.088
4	DLA1131	54	5	1.885	0.463	0.469	0.014
5	5ACA	54	5	2.094	0.481	0.522	0.078
6	5ACT	54	4	2.465	0.611	0.594	-0.028
7	5BCA	54	4	1.553	0.370	0.356	-0.040

Mastiff

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	23	5	3.014	0.826	0.668	-0.236
2	DLA I-4ACA	23	4	2.852	0.826	0.649	-0.272
3	DLA I-4BCT	23	3	2.232	0.652	0.552	-0.182
4	DLA1131	23	3	2.232	0.652	0.552	-0.182
5	5ACA	23	4	2.246	0.652	0.555	-0.175
6	5ACT	23	4	2.466	0.783	0.595	-0.316
7	5BCA	23	3	1.358	0.304	0.264	-0.154

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - English Mastiff

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - English Mastiff

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media