Statistics and Breed-wide Allele Frequency - English Mastiff

Updated Jun 14, 2026

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA1 #	STR types	English Mastiff (n=31)	Mastiff (n=22)
1006	387 375 293 180	--	0.02
1016	382 371 277 178	0.15	0.14
1030	380 373 293 178	0.08	--
1033	382 379 277 181	0.02	--
1052	380 372 289 184	0.02	--
1056	386 373 289 190	0.21	0.32
1066	376 375 277 178	0.53	0.45
1221	380 365 293 180	--	0.07

DLA Class II Haplotype Frequencies

DLA2 #	STR types	English Mastiff (n=31)	Mastiff (n=22)
2014	339 322 284	0.15	0.14
2017	343 322 280	0.21	0.30
2023	341 323 282	0.08	--
2037	341 327 280	0.02	--
2046	339 329 280	0.52	0.45
2086	339 329 284	0.02	--
2117	353 327 280	--	0.02
2118	347 327 280	--	0.07
2128	343 323 288	0.02	0.02

Allele Frequencies

#	Locus Name	Allele	English Mastiff (n=31)	Mastiff (n=22)
1	AHT121	92	0.02	--
		94	0.10	0.09
		96	0.13	0.23
		100	0.56	0.45
		102	0.18	0.14
		104	0.02	0.07
		108	--	0.02
2	AHT137	131	0.27	0.41
		137	0.16	0.34
		139	0.02	--
		141	--	0.05
		145	0.02	0.02
		147	0.11	0.02
		149	0.42	0.16
3	AHTH130	119	--	0.09
		121	0.35	0.39
		123	--	0.05
		125	0.02	0.02
		127	0.31	0.23
		129	0.18	0.16
		131	0.13	0.07
		135	0.02	--
4	AHTh171-A	219	0.27	0.30
		223	0.13	0.05
		225	0.24	0.27
		227	0.02	--
		229	0.05	0.07
		231	0.10	0.05
		233	0.11	0.16
		235	0.03	--
		237	0.05	0.11
5	AHTh260	238	0.56	0.41
		242	0.03	0.02
		244	0.10	0.20
		246	0.08	0.20
		250	0.23	0.16
6	AHTk211	87	0.19	0.30
		89	0.73	0.66
		91	0.03	--
		93	0.03	--
		95	0.02	0.05
7	AHTk253	286	0.61	0.70
		288	0.11	0.07
		290	0.05	0.07
		292	0.18	0.11
		296	0.05	0.05
8	C22.279	116	0.27	0.25
		118	0.08	0.11
		120	0.37	0.48
		122	0.02	--
		126	0.26	0.16
9	FH2001	128	0.03	0.02
		132	0.40	0.43
		140	0.02	0.05
		144	0.32	0.25
		156	0.23	0.25
10	FH2054	152	0.60	0.61
		156	0.16	0.23
		160	0.10	0.09
		164	0.13	0.05
		168	0.02	0.02
11	FH2848	236	0.05	0.09
		238	0.34	0.39
		240	0.44	0.41
		242	0.10	0.09
		244	0.08	0.02
12	INRA21	93	0.03	--
		95	0.45	0.61
		97	0.10	0.11
		101	0.34	0.25
		103	0.08	0.02
13	INU005	110	0.02	0.07
		122	0.05	0.02
		124	0.87	0.86
		126	0.06	--
		132	--	0.05
14	INU030	144	0.34	0.36
		148	0.03	0.11
		150	0.63	0.52
15	INU055	210	0.27	0.16
		214	0.02	--
		216	0.02	--
		218	0.69	0.82
		220	--	0.02
16	LEI004	85	0.11	0.02
		95	0.10	0.23
		97	0.03	--
		105	0.13	0.14
		107	0.63	0.61
17	REN105L03	233	0.35	0.34
		235	0.18	0.09
		237	0.45	0.55
		245	0.02	0.02
18	REN162C04	202	0.60	0.86
		204	0.15	0.02
		208	0.26	0.11
19	REN169D01	202	0.15	0.11
		210	--	0.02
		212	0.40	0.32
		216	0.45	0.55
20	REN169O18	162	--	0.05
		164	0.02	0.02
		166	0.02	--
		168	0.11	0.09
		170	0.10	0.14
		172	0.76	0.70
21	REN247M23	268	0.84	0.89
		270	0.05	0.11
		272	0.10	--
		278	0.02	--
22	REN54P11	226	0.03	0.05
		228	--	0.05
		232	0.06	0.16
		234	0.15	0.09
		236	0.65	0.55
		238	0.11	0.11
23	REN64E19	145	0.11	0.09
		147	0.06	0.14
		149	0.03	0.11
		151	0.02	--
		153	0.77	0.66
24	VGL0760	12	0.10	0.07
		13	0.29	0.23
		20.2	--	0.02
		21.2	0.44	0.48
		22.2	0.10	0.16
		23.2	0.08	0.02
		24.2	--	0.02
25	VGL0910	12	0.15	0.20
		13	0.03	0.02
		14	--	0.02
		16.1	--	0.02
		17.1	0.11	0.02
		18.1	0.21	0.16
		19.1	0.26	0.27
		20.1	0.16	0.11
		21.1	0.05	--
		22.1	0.03	0.14
		24.1	--	0.02
26	VGL1063	13	0.11	0.09
		14	0.74	0.82
		15	0.08	0.07
		19	0.03	0.02
		20	0.03	--
27	VGL1165	15	0.34	0.39
		16	0.02	0.05
		17	0.05	--
		18	0.10	0.14
		19	0.16	0.27
		21	0.02	--
		23	0.06	0.02
		26	0.03	0.05
		27	0.19	0.09
		28	0.03	--
28	VGL1828	15	0.18	0.07
		16	0.34	0.32
		17	--	0.02
		19	0.27	0.41
		20	0.21	0.14
		24	--	0.05
29	VGL2009	9	0.11	0.18
		10	0.02	0.02
		11	0.13	0.07
		12	0.02	--
		13	0.56	0.55
		14	0.16	0.18
30	VGL2409	13	0.05	--
		14	--	0.02
		16	0.02	--
		17	0.35	0.41
		18	0.31	0.36
		19	0.24	0.20
		20	0.02	--
		22	0.02	--
31	VGL2918	12	0.06	0.05
		13	0.37	0.25
		14	0.15	0.23
		15	0.02	0.07
		17.3	0.03	0.09
		18.3	0.03	0.07
		19.3	0.32	0.25
		20.3	0.02	--
32	VGL3008	14	0.05	--
		15	0.02	--
		16	0.03	--
		17	0.06	--
		18	0.31	0.25
		19	0.40	0.55
		20	0.08	0.07
		21	0.05	0.14
33	VGL3235	13	0.18	0.23
		14	0.21	0.20
		16	0.06	0.07
		17	0.53	0.45
		18	0.02	0.05

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

English Mastiff

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	53	5.909	2.892	0.592	0.604	0.021
	SE		0.322	0.190	0.028	0.026	0.016

Mastiff

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	22	4.939	2.808	0.601	0.587	-0.026
	SE		0.278	0.186	0.031	0.029	0.020

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

English Mastiff

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	53	4.571	2.218	0.544	0.530	-0.023
	SE		0.341	0.168	0.043	0.036	0.019

Mastiff

		N	Na	Ne	Ho	He	F
	Mean	22	3.714	2.325	0.701	0.545	-0.275
	SE		0.265	0.188	0.066	0.046	0.023

Standard genetic assessment for individual STR loci

English Mastiff

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	53	7	2.991	0.642	0.666	0.036
2	AHT137	53	7	3.730	0.604	0.732	0.175
3	AHTH130	53	8	3.968	0.736	0.748	0.016
4	AHTh171-A	53	9	5.366	0.774	0.814	0.049
5	AHTh260	53	5	3.053	0.623	0.672	0.074
6	AHTk211	53	5	1.837	0.472	0.456	-0.036
7	AHTk253	53	5	2.170	0.547	0.539	-0.015
8	C22.279	53	5	3.354	0.585	0.702	0.167
9	FH2001	53	5	3.174	0.660	0.685	0.036
10	FH2054	53	5	2.391	0.472	0.582	0.189
11	FH2848	53	5	3.075	0.717	0.675	-0.063
12	INRA21	53	5	2.669	0.585	0.625	0.065
13	INU005	53	5	1.319	0.208	0.242	0.143
14	INU030	53	3	2.135	0.509	0.532	0.042
15	INU055	53	5	1.648	0.453	0.393	-0.152
16	LEI004	53	5	2.304	0.623	0.566	-0.100
17	REN105L03	53	4	2.612	0.679	0.617	-0.101
18	REN162C04	53	3	1.822	0.396	0.451	0.122
19	REN169D01	53	4	2.541	0.566	0.606	0.067
20	REN169O18	53	6	1.767	0.340	0.434	0.218
21	REN247M23	53	4	1.340	0.264	0.254	-0.040
22	REN54P11	53	6	2.469	0.623	0.595	-0.046
23	REN64E19	53	5	1.812	0.434	0.448	0.032
24	VGL0760	53	7	3.328	0.642	0.700	0.083
25	VGL0910	53	11	5.970	0.906	0.833	-0.088
26	VGL1063	53	5	1.623	0.377	0.384	0.017
27	VGL1165	53	10	4.697	0.717	0.787	0.089
28	VGL1828	53	6	3.730	0.811	0.732	-0.108
29	VGL2009	53	6	2.704	0.698	0.630	-0.108
30	VGL2409	53	8	3.291	0.698	0.696	-0.003
31	VGL2918	53	8	4.335	0.811	0.769	-0.055
32	VGL3008	53	8	3.232	0.679	0.691	0.016
33	VGL3235	53	5	2.963	0.679	0.663	-0.025

Mastiff

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	AHT121	22	6	3.445	0.727	0.710	-0.025
2	AHT137	22	6	3.205	0.591	0.688	0.141
3	AHTH130	22	7	4.137	0.773	0.758	-0.019
4	AHTh171-A	22	7	4.792	0.818	0.791	-0.034
5	AHTh260	22	5	3.612	0.636	0.723	0.120
6	AHTk211	22	3	1.909	0.500	0.476	-0.050
7	AHTk253	22	5	1.921	0.500	0.479	-0.043
8	C22.279	22	4	3.044	0.636	0.671	0.052
9	FH2001	22	5	3.184	0.682	0.686	0.006
10	FH2054	22	5	2.278	0.455	0.561	0.190
11	FH2848	22	5	2.997	0.818	0.666	-0.228
12	INRA21	22	4	2.210	0.455	0.548	0.170
13	INU005	22	4	1.328	0.227	0.247	0.079
14	INU030	22	3	2.390	0.636	0.582	-0.094
15	INU055	22	3	1.438	0.364	0.305	-0.193
16	LEI004	22	4	2.236	0.682	0.553	-0.234
17	REN105L03	22	4	2.367	0.636	0.577	-0.102
18	REN162C04	22	3	1.317	0.273	0.241	-0.133
19	REN169D01	22	4	2.426	0.545	0.588	0.072
20	REN169O18	22	5	1.902	0.455	0.474	0.041
21	REN247M23	22	2	1.252	0.227	0.201	-0.128
22	REN54P11	22	6	2.872	0.682	0.652	-0.046
23	REN64E19	22	4	2.109	0.636	0.526	-0.210
24	VGL0760	22	7	3.216	0.773	0.689	-0.121
25	VGL0910	22	10	5.694	0.864	0.824	-0.048
26	VGL1063	22	4	1.464	0.273	0.317	0.140
27	VGL1165	22	7	3.919	0.682	0.745	0.085
28	VGL1828	22	6	3.396	0.773	0.706	-0.095
29	VGL2009	22	5	2.711	0.636	0.631	-0.008
30	VGL2409	22	4	2.924	0.773	0.658	-0.174
31	VGL2918	22	7	5.095	0.773	0.804	0.039
32	VGL3008	22	4	2.609	0.591	0.617	0.042
33	VGL3235	22	5	3.259	0.727	0.693	-0.049

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

English Mastiff

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	53	5	2.899	0.698	0.655	-0.066
2	DLA I-4ACA	53	6	2.691	0.679	0.628	-0.081
3	DLA I-4BCT	53	3	1.997	0.472	0.499	0.055
4	DLA1131	53	5	1.849	0.472	0.459	-0.027
5	5ACA	53	5	2.060	0.491	0.515	0.047
6	5ACT	53	4	2.462	0.623	0.594	-0.049
7	5BCA	53	4	1.566	0.377	0.362	-0.044

Mastiff

#	Locus	N	Na	Ne	Ho	He	F
1	DLA I-3CCA	22	5	3.016	0.864	0.668	-0.292
2	DLA I-4ACA	22	4	2.839	0.864	0.648	-0.333
3	DLA I-4BCT	22	3	2.180	0.682	0.541	-0.260
4	DLA1131	22	3	2.180	0.682	0.541	-0.260
5	5ACA	22	4	2.195	0.682	0.544	-0.252
6	5ACT	22	4	2.488	0.818	0.598	-0.368
7	5BCA	22	3	1.377	0.318	0.274	-0.162

Veterinary Genetics Laboratory

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - English Mastiff

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Statistics and Breed-wide Allele Frequency - English Mastiff

DLA Class I Haplotype Frequencies

DLA Class II Haplotype Frequencies

Allele Frequencies

Standard genetic assessment based on 33 autosomal STR loci

Standard genetic assessment based on 7 STRs in the DLA region

Standard genetic assessment for individual STR loci

Standard genetic assessment for 7 STRs in the DLA region

Contact the VGL

Connect with us on social media